انتظمت امتحانات جامعة المغتربين في ثلاثة مراكز حسب أماكن وجود الطلاب (بعد اندلاع الحرب) في كل من القضارف والرياض والقاهرة، تحت إشراف لجنة الامتحانات المركزية واللجان الفرعية في المراكز الثلاثة، وبمتابعة مباشرة من الاستاذ الدكتور عثمان الحسن محمد نور رئيس الجامعة لسير عملية الامتحانات التي تستمر ثلاثة أسابيع، م تعقبها إجازة قصيرة ليبدا الفصل الدراسي الثاني. والجدير بالذكر ان الدراسة في جامعة المغتربين قد بدأت اول يناير 2024 علي ثلاثة محاور : الدراسة حضوريَّاً بجامعة القضارف، بعد ان ابرمت الجامعة اتفاقية مع جامعة القضارف، والمحور الثاني التدريس من خلال المنصَّة الإلكترونية، والمحور الثالث من خلال التدريب السريري لطلاب السنتين الرابعة والخامسة (طب) في مجموعة مستشفيات السعودي الألماني في كل من السعودية والإمارات ومصر.